《温病条辨》由吴瑭（字鞠通）著。该书在清代众多温病学家成就的基础上，进一步建立了完全独立于伤寒的温病学说体系，创立了三焦辨证纲领，为清代温病学说标志性专著。《温病条辨》重申寒、温分立，提出病因有三（伏气、时气、戾气），病类为九（风温、温热、温疫、温毒、暑温、秋燥、冬温、温疟）；创立了三焦辨证纲领。吴氏的三焦辨证不仅层次清晰、明确，而且能落实到具体脏腑，而非难以捉摸的“膜原”。从历史发展的角度来看，该辨证体系与张仲景伤寒六经辨证、叶天士温热卫气营血辨证理论互为羽翼，是温病创新理论之一。该书提出了一系列的温病治疗原则，成为此后温病治疗的圭臬，其中一些学术见解直到现在仍为临床医家所重视。
卷首原病篇
卷一 上焦篇
风温 温热 温疫 温毒 冬温
暑温
伏暑
湿温寒湿
温疟
秋燥
补秋燥胜气论
卷二 中焦篇
风温 温热 温疫 温毒 冬温
暑温伏暑
寒湿
湿温疟、痢、疸、痹附
秋燥
卷三 下焦篇
风温 温热 温疫 温毒 冬温
暑温 伏暑
寒湿 便血、咳嗽、疝瘕附
湿温 疟、痢附
秋燥
卷四 杂说
汗论
方中行先生或问六气论
伤寒注论
风论
医书亦有经子史集论
本论起银翘散论
本论粗具规模论
寒疫论
伪病名论
温病起手太阴论
燥气论
外感总数论
治病法论
吴又可温病禁黄连论
风温、温热气复论
治血论
九窍论
形体论
卷五 解产难
解产难题词
产后总论
产后三大证论一
产后三大证论二
产后三大证论三
产后瘀血论
产后宜补宜泻论
产后六气为病论
产后不可用白芍辩
产后误用归芎亦能致瘛论
产后当究奇经论
下死胎不可拘执论
催生不可拘执论
产后当补心气论
产后虚寒虚热分别论治论
保胎论一
保胎论二
卷六 解儿难
解儿难题词
儿科总论
俗传儿科为纯阳辩
儿科用药论
儿科风药禁
痉因质疑
湿痉或问
痉有寒热虚实四大纲论
小儿痉病瘛病共有九大纲论
寒痉
风温痉
温热痉
暑痉
湿痉
燥痉
内伤饮食痉
客忤痉
本脏自病痉
小儿易痉总论
痉病瘛病总论
六气当汗不当汗论
疳疾论
痘证总论
痘证禁表药论
痘证初起用药论
治痘明家论
痘疮稀少不可恃论
痘证限期论
行浆务令满足论
疹论
泻白散不可妄用论
万物各有偏胜论
草木各得一太极论
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